会计硕士专业学位（Master of Professional Accounting，简称MPAcc）是经中华人民共和国国务院学位办批准设立的专业学位，该项目是一个理论和实际相结合的硕士培养项目，也是最高学历层次的会计实务教育。南京大学是全国首批开展会计硕士专业学位（MPAcc）教育的高校之一，2010年又被教育部批准为全国首批进行会计专业学位研究生教育综合改革试点的两所学校之一。

审计硕士专业学位（Master of Auditing，英文简称为MAud）是经国务院学位办批准设立的专业学位，旨在培养具有开阔的国际视野、较强的专业能力、能够创造性地从事审计工作的高层次、应用型审计专门人才。南京大学是2011年全国首批开展审计硕士专业学位（MAud）教育的学校，2012年开始正式招生。

南京大学MPAcc、MAud项目扎根于南京大学的人文、科学的文化土壤，得益于南京大学校风、学风的深厚滋养，以南京大学人文社科与自然科学两大领域的深厚积淀为依托，在商学院经济学与管理学两大学科交叉融合的基础上，以会计、审计学科发展为核心，自2004年以来培养了2000余名财会审专业管理人才。

在会计面临信息技术巨大变革时代，南京大学着力从现代商业伦理、科学思维、人文素养、主动适应信息技术变革、综合实践管理能力等方面为社会各界培养能够适应现代化信息技术变革，懂专业、擅管理、通人文且具有财务与会计专业背景的领导者与管理精英。